Valencia, Sevilla, Atlético de Bilbao, camiseta valencia cf Barcelona y Madrid eran los principales rivales para conseguirlo. En el transcurso de su sanción, Aparicio vivió en Santander y practicó otros deportes para mantenerse en forma, mientras recibía jugosas ofertas de otros equipos como Madrid y Barcelona. En la defensa, el dúo Riera y Aparicio se convirtió en habitual, con los recambios de Cobo y Mesa. Echaban de menos a Gabilondo por su lesión, a Aparicio por su sanción y a un 9 que culminara las jugadas del equipo. Aquella temporada, Ricardo Zamora siguió como entrenador del equipo que presidía Manuel Gallego. El año pasado, que no partía el gran favorito, se midió en esta misma instancia al Chelsea, al que nunca había logrado ganar. Ese año el equipo consiguió el ascenso en su primer año de vida. En 1942 retorna al Slovan Bratislava, al que entrena durante cuatro temporadas, compaginando las dos primeras con su labor como Seleccionador Eslovaco, un cargo que en cierto modo “repetirá” en 1948, año en el que dirige a la Selección de Checoslovaquia. En los cuartos de final, la suerte no sonrió al Atlético Aviación ya que le tocó el Atlético de Bilbao, campeón de Liga. El Atlético Aviación partía con el objetivo de pelear por el título de Liga y olvidar el decepcionante octavo puesto de la temporada anterior.
Barça y Madrid suspiran por las mejores versiones de sus arietes para acercarse a un título que, para ambos, se presenta a estas alturas como un objetivo prioritario. Juanfran pasó a formar parte del Real Madrid Castilla, primer equipo filial del Real Madrid, con la esperanza de ayudar al equipo a ascender a la Segunda División. El principal partido del Gobierno autonómico, el Partido Popular, obtuvo su primera mayoría absoluta en la región. El 21 de junio, en el partido de desempate disputado en Las Corts, el Atlético Aviación perdió por 3-2, no pudiendo disputar la final. Siete días después, en la vuelta, el Bilbao venció por 2-0, por lo que se tuvo que jugar un encuentro de desempate para dilucidar quién sería el finalista que se enfrentaría al Valencia. Una semana después, pese a la derrota del conjunto ché en Oviedo, el Atlético no pudo pasar del empate a cero contra el Granada en el Metropolitano. Ricardo Zamora confiaba en un once tipo: Ederra en la portería; Mesa y Riera en la zaga; Amestoy, Germán y Machín en el centro del campo; Androver, Arencibia, Taltavull, Campos y Vázquez en la delantera.
Así, la plantilla rojiblanca quedó conformada por: Ederra, Guillermo, Abel Mariano, Palacios, Jimeno, Colón, Aparicio, Riera, Gabilondo, Germán, Machín, Adrover, Amestoy, Taltavull, Campos, Vázquez, Mesa, Casaus, Cuenca, Oscar, Lozano, Arencibia, Cobo, Farias, Juncosa, Martín, Manuel Jorge, Pío, Fraga y Mencía. En la línea media, Gabilondo y Germán siguieron llevando el peso del equipo mientras que Machín perdió protagnismo en favor del joven Cuenca, además Amestoy, Mencía, Farias y Santana actuaron en algunas ocasiones. El título fue el decimotercero del Real, otro récord de la Liga de Campeones, y el cuarto en cinco años. En dicha ronda, el bombo les cruzó con el vigente campeón, el Atlético de Bilbao, camisetas barcelona baratas que había quedado décimo en Liga. En la jornada 19, el Atlético se jugaba media Liga, ya que recibía al Valencia que le aventajaba seis puntos. En la jornada 22, el Valencia dio un paso de gigante hacia la conquista de la Liga, venciendo al Celta el mismo día que el Atlético perdía contra el Sevilla en Nervión.
Campeonato de España de 1905. Sin embargo, unas disensiones internas a finales de 1907 provocó que los futbolistas decidieran crear una nueva entidad, el San Sebastián Foot-Ball Club. Les tocó en suerte un duro rival: el Sevilla, tercero en el campeonato liguero. La formación rojiblanca, salvada ya del descenso y lejos de los primeros puestos, se limitó a cumplir el expediente en la recta final del campeonato liguero. El Atlético Aviación se encontraba en aquel momento en la élite del fútbol español, incluso por encima del Real Madrid en la capital. El 7 de febrero, en la 19.ª jornada liguera, el Atlético Aviación jugó su último partido en el Estadio de Vallecas, ganando por 1-0 al Sevilla con gol de Campos en el minuto 90. El 18 de febrero se entrenaron por primera vez en el nuevo campo y el 21 de febrero se reinauguró el Estadio Metropolitano con victoria atlética por 2-1 contra el Real Madrid en la 20.ª jornada.