| Fondation |
|---|
| Sigle | |
|---|---|
| Type | |
| Domaine d'activité | |
| Siège | |
| Pays | |
| Coordonnées |
| Organisation mère | |
|---|---|
| Site web |
modifier - modifier le code - modifier Wikidata👁 Documentation du modèle
Le National Center for Biotechnology Information (NCBI, littéralement en français : « Centre national pour les informations biotechnologiques ») est un institut national américain pour l'information biologique moléculaire.
Historique
[modifier | modifier le code]Cet organisme, fondé en 1988 et situé à Bethesda dans le Maryland, fait partie de la Bibliothèque américaine de médecine, un des Instituts américains de la santé.
Missions
[modifier | modifier le code]Le NCBI conduit des recherches dans la biologie informatique, développe des logiciels pour analyser des données de génome et fournir des informations biomédicales.
Le NCBI n'est pas une base de données, mais il développe aussi des bases de données publiques telles que :
Il est en quelque sorte le pendant américain de l’Institut européen de bio-informatique (EBI).
Le NCBI propose et contient une base de données NCBI taxonomy qui n'est qu'indicative. Le site internet du NCBI précise que cette base n'est pas une source fiable pour la nomenclature ou de classification, et qu'il faut consulter la littérature scientifique pertinente pour les informations les plus fiables[1]. La taxonomie du NCBI représente environ 10 % des espèces vivantes de la planète. Cette taxonomie est une classification curée et se propose comme une nomenclature organisée pour les séquences d'organismes dans des bases de données publiques[2],[3].
Le TaxID (identifiant unique dans la taxonomie du NCBI) sert de lien entre les trois bases de données du International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC, en français : « Collaboration internationale en bases de données de séquences nucléotidiques »)[4] dont sont membres la DNA Data Bank of Japan (DDBJ), le NCBI (États-Unis) et l'Institut européen de bio-informatique (EMBL-EBI, Europe)[5].
Notes et références
[modifier | modifier le code]- ↑ (en) « Disclaimer: The NCBI taxonomy database is not an authoritative source for nomenclature or classification - please consult the relevant scientific literature for the most reliable information. » (Voir bas de page sur cet exemple de recherche.)
- ↑ (en) « Home - Taxonomy », sur ncbi.nlm.nih.gov (consulté le ).
- ↑ « Terminologie - NCBI Taxonomie », (consulté le )
- ↑ (en) Scott Federhen, Karen Clark, Tanya Barrett et Helen Parkinson, « Toward richer metadata for microbial sequences: replacing strain-level NCBI taxonomy taxids with BioProject, BioSample and Assembly records », Standards in Genomic Sciences, vol. 9, no 3, , p. 1275 (ISSN 1944-3277, DOI 10.4056/sigs.4851102, lire en ligne, consulté le ).
- ↑ (en) « International Nucleotide Sequence Database Collaboration », sur insdc.org (consulté le ).
Voir aussi
[modifier | modifier le code]Articles connexes
[modifier | modifier le code]- Entrez, le système global de recherches inter-bases de données du NCBI.
- BLAST, un logiciel du NCBI, permettant la comparaison de séquences de nucléotides et de protéines.
- La liste des pages Wikipédia décrivant un taxon utilisant une référence au NCBI.
Liens externes
[modifier | modifier le code]- (en) Site officiel👁 Voir et modifier les données sur Wikidata
- Ressource relative à la recherche👁 Voir et modifier les données sur Wikidata
: - (en) Site officiel
- (en) Sa base de données taxonomique
| Bases de données |
|
||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Institutions | |||||||||
| Algorithme | |||||||||
| Divers | |||||||||
- Page utilisant P571
- Page utilisant P1813
- Page utilisant P31
- Page utilisant P101
- Page utilisant P159
- Page utilisant P17
- Page géolocalisée par Wikidata
- Article géolocalisé aux États-Unis
- Page utilisant P749
- Page utilisant P856
- Page utilisant P18
- Article utilisant l'infobox Organisation2
- Article utilisant une Infobox
- Page utilisant P2740
- Page pointant vers des bases externes
- Page pointant vers des bases relatives à la recherche
- Article utilisant le modèle Dictionnaires inactif
- Article de Wikipédia avec notice d'autorité
- Portail:Biologie cellulaire et moléculaire/Articles liés
- Portail:Biologie/Articles liés
- Portail:Sciences/Articles liés
- Projet:Biologie/Pages liées
- Portail:Maryland/Articles liés
- Portail:Amérique/Articles liés
- Portail:États-Unis/Articles liés
- Portail:Amérique du Nord/Articles liés
- Page avec des cartes
