Rösterna föll 92 mot 10 då Israels parlament Knesset röstade för att förbjuda Unrwa.
I praktiken handlar det om två lagförslag som tillsammans gör det omöjligt för FN-organisationen att fungera i Israel och Gaza.
Unrwa får inte längre operera på israeliskt territorium, sedan en överenskommelse om organisationens arbete i regionen från 1967 rivs upp. För det andra förbjuder Israel också alla alla kontakter mellan Unrwa och de israeliska myndigheterna.
Eftersom Unrwa är beroende av Israel för att överhuvudtaget få tillstånd att passera gränskontrollerna till Gaza och Västbanken kommer biståndsaktiviteterna i området nu att upphöra i stor utsträckning.
Lagarna väntas träda i kraft efter en övergångsperiod på tre månader.
Kritikstorm mot beslutet
”Beslutet kommer enbart att fördjupa palestiniernas lidande, särskilt i Gaza”, säger Unrwas chef Phillippe Lazzarini.
Palestinska Hamas säger för sin del att beslutet är ett led i folkmordet mot människorna i Gaza.
Omvärlden har också på förhand kritiserat lagförslagen hårt.
Enligt The Guardian har 123 länder redan fördömt lagförslagen.
Även EU har tagit avstånd från dem och Israels viktigaste allierade, USA, har uppmanat Israel att förkasta planerna. USA har bland annat hotat att dra in sitt militära stöd om Israel fortsätter att förhindra den humanitära hjälpen till Gaza.
Också i Norden är man djupt oroad av förbudet mot Unrwa.
Finland har tillsammans med de fyra nordiska grannländerna i ett gemensamt uttalande konstaterat att det väntade beslutet skulle ha ”förödande konsekvenser”.
Länderna betonar också att beslutet skulle kunna kränka internationell rätt och Internationell domstolens (ICJ) beslut, som kräver att Israel tillgodoser Gazabornas behov av humanitärt bistånd.
”Det är en katastrof om [lagarna] antas och implementeras”, sa Unrwas kommunikationschef Juliette Touma inför omröstningen i parlamentet.
”Unrwa är den största humanitära organisationen i Gaza… Vem kan göra dess jobb?”
Enligt Israel nödvändigt att stoppa Unrwa
Förslagen introducerades av parlamentsledamöter som anser att förslagen är både nödvändiga och rättvisa.
Unrwa blev nageln i ögat för Israel och föremål för omfattande utredningar då det visade sig att flera av Unrwa:s medarbetare hade kopplingar till Hamas och hade deltagit i terrorattackerna mot Israel den sjunde oktober i fjol.
Många länder stoppade tillfälligt sitt stöd till Unrwa på grund av uppgifterna om Hamaskopplingarna, men anser ändå nu att Unrwa spelar en avgörande roll för att hjälpa den palestinska civilbefolkningen.
Unrwa avskedade nio av sina anställda till följd av misstankarna, men uppger att ”en absolut överväldigande majoritet” följer reglerna om neutralitet och att ”endast 0,22 procent” av dess anställda har blivit föremål för utredning.
Israel på kollisionskurs med FN
En del bedömare befarar att Israel nu är på väg att permanent bryta sina band med FN.
The Jerusalem Post rapporterar att FN:s medlemsländer väntas reagera starkt mot lagarna och att FN kan frånta Israel rösträtten eller den israeliska FN-delegationens ackreditering.
FN:s tidigare undergeneralsekreterare för humanitära frågor, Jan Egeland, bedömer att situationen kan vara värre än så. Egeland konstaterar att lagförslagen är i strid med FN:s resolutioner och själva FN-stadgan.
”En möjlig konsekvens är att Israel slängs ut ur FN”, säger Egeland till den norska rundradion, NRK.
Israel har redan under längre tid varit på kollisionskurs med FN och dess organ: ICJ:s beslut om att de israeliska bosättningarna är olagliga har väckt ilska i Israels läger och FN:s generalsekreterare António Guterres har utnämnts till en icke-önskvärd person, som inte är välkommen i Israel.
Källa: AP