Di sanalah ia ditemukan oleh Paulo César Carpegiani, yang mengundangnya untuk bergabung dengan RS Futebol di selatan Brasil. Bergabung dengan klub pada akhir tahun 2001, Silva menjadi pemain profesional pada tahun 2002 dan berkompetisi di divisi ketiga Campeonato Gaúcho, menempati posisi kedua dan mencapai promosi ke divisi kedua negara bagian.^[8]

Silva pindah ke Juventude pada 2004, di mana ia bermain selama enam bulan. Pada usia 20 tahun, Silva beralih dari lini tengah ke pertahanan di bawah asuhan Ivo Wortmann. Dalam satu-satunya musim di Juventude, Silva dianggap sebagai wahyu musim ini.^[8]

Silva dibeli oleh Porto seharga €2,5 juta pada tahun 2004, tetapi bermain hanya untuk tim cadangan.^[8]

Setelah satu tahun di Portugal, ia bergabung dengan Dynamo Moscow, di mana ia didiagnosis menderita TBC dan dirawat di rumah sakit selama enam bulan.^[8]

Pada 14 Januari, Fluminense mengumumkan penandatanganan Silva dari Porto. 2007 adalah tahun yang jauh lebih baik bagi Fluminense dan Silva. Klub selesai di tempat keempat di Brasileirao 2007. Setelah memenangkan Copa do Brasil, Silva diakui oleh penggemar sebagai bek terbaik di Brasil. Di akhir musim, ia menjadi salah satu dari tiga nominasi untuk penghargaan Bek Tengah Terbaik, bersama Breno dan Fábio Luciano.^[8]

Silva setuju untuk pindah ke Milan dengan biaya €10 juta, dengan gaji bersih €2,5 juta dengan kontrak empat tahun. Silva memainkan pertandingan pertamanya untuk Rossoneri dalam pertandingan persahabatan melawan Hannover 96 pada 21 Januari 2009; dia bermain bagus, membuat sepuluh tekel. Penampilannya mendapat pujian dari eksekutif Milan Adriano Galliani dan rekan setimnya Clarence Seedorf.^[8]

Pada kedatangannya, Silva disajikan kepada media sebagai "bek terbaik di dunia" oleh presiden PSG Nasser Al-Khelaifi. Kemudian pelatih PSG, dan mantan pelatihnya bersama Milan, Carlo Ancelotti, mengaku kepada media Prancis bahwa Silva datang ke klub dalam keadaan cedera, dan tidak akan bisa langsung diturunkan dalam pertandingan.

Pada musim 2012/13, Silva menerima penghargaan Pemain Terbaik Ligue 1 Bulan Maret, dengan 71% suara, setelah beberapa penampilan fantastis.

Silva melanjutkan penampilan hebatnya dalam kemenangan 1-0 ketat PSG melawan Troyes. Musim Silva berakhir pada 5 Mei ketika ia menerima kartu merah langsung dalam pertandingan melawan Valenciennes.

Musim Silva dimulai dengan kemenangan 2-1 di Piala Super Prancis melawan Bordeaux, itu adalah pertama kalinya Paris Saint-Germain memenangkan trofi sejak 1998. Pada 19 April, Silva menjadi kapten PSG untuk kemenangan 2-1 di Final Coupe de la Ligue 2014, pertama kalinya klub memenangkan kompetisi sejak 1998.

Musim Silva dimulai dengan buruk saat PSG bermain imbang 2-2 dengan Reims. Pada 11 April, Silva menjadi kapten klub untuk kemenangan 4-0 di final Coupe de la Ligue melawan Bastia.

Setelah kemenangan luar biasa 6-0 melawan Guingamp yang membawa klub lebih dekat ke treble domestik Prancis pertama yang mungkin, Silva mengklaim bahwa tim PSG ini adalah yang terbaik yang pernah dia mainkan. Satu minggu kemudian, PSG merebut gelar Ligue 1 dengan susah payah. -melawan kemenangan tandang 2-1 di Montpellier.

Pertandingan pra-musim pertama yang dimainkan Silva adalah pertandingan final International Champions Cup 2015 melawan Manchester United, di mana PSG menang 2-0 untuk memenangkan trofi.

Silva dinilai sebagai pemain terbaik pada pertandingan tersebut. Dua hari kemudian, Silva menjadi kapten PSG untuk kemenangan 2-0 di Trophée des Champions 2015 melawan Lyon.

Pada 28 Agustus 2020, Silva bergabung dengan klub Liga Premier Chelsea dengan kontrak satu tahun dengan opsi untuk yang kedua. Dia melakukan debut untuk klub pada 23 September, dalam kemenangan kandang 6-0 atas Barnsley di putaran ketiga Piala EFL.

Pada tanggal 29 Mei, Silva mengalami cedera pada menit ke-39 saat ia memenangkan trofi Liga Champions pertamanya setelah kemenangan 1-0 Chelsea melawan Manchester City di Final Liga Champions UEFA 2021 di Estádio do Dragão.^[8]