A sua chegada a Luz coincidiu com o melhor período de Eliseu, sendo por isso pouco utilizado no Campeonato. Mesmo assim, foi o titular no jogo do Título e ainda jogou a final da Taça da Liga (em que esteve em bom plano) conquistada pelo Benfica.

Grimaldo aproveitou bem a ausência de Eliseu durante a pré-época, devido aos compromissos da seleção portuguesa que ganhou a final do Europeu na França. Com os jogos a titular durante a pré-temporada, Álex Grimaldo foi o natural titular do lado esquerdo da defesa na Super Taça Cândido de Oliveira e assumiu-se como titular indiscutível da equipa. Marcou o seu primeiro gol pelo Benfica em jogo da 5.ª jornada do campeonato nacional, frente ao Braga, através de livre direto. Apesar deste bom inicio, o espanhol contraiu uma grave lesão a 23 de outubro de 2016, ante o Belenenses (jogo onde também apontou um tento), permitindo a ascensão tanto de Eliseu como de um adaptado André Almeida a titularidade, regressando somente em abril de 2017, ainda a tempo de realizar um bom final de época, despertando a cobiça de clubes italianos, com o Napoli a cabeça. Realizou um total de 21 Jogos na temporada, apontando 2 gols.